Eu também tenho isso no Vista. A resolução do meu laptop é 1366x768 e tenho um monitor conectado em 1680x1050. Quando fecho a tampa e recomeço, as janelas são tecnicamente maximizadas, mas na tela do laptop a janela começa a mostrar as bordas, como se fosse uma janela não maximizada, arrastada para esse tamanho. No segundo monitor, a janela é do tamanho da tela do meu laptop, não do tamanho total do monitor. Esta imagem mostra o que quero dizer:
Postei nos fóruns do UltraMon (acreditando ser um bug no UltraMon) e o único conselho que consegui receber foi que poderia ser causado por um serviço chamado TMM:
Algumas pessoas relataram que esse problema foi causado pelo TMM, um serviço instalado no Vista. Você pode desativá-lo em Painel de Controle> Ferramentas Administrativas> Agendador de Tarefas> Microsoft> Windows> MobilePC.
Infelizmente, isso não funcionou para mim e vi outros tópicos em que as pessoas simplesmente dizem "é um bug do Windows". Portanto, não há nada que você possa fazer no AFAIK.