Você provavelmente está sobrecarregado com um SSD que usa o infame controlador JMicron JMF602. O fato de ser um dispositivo SATA e USB é uma dica, já que o JMF602 é um dos poucos controladores com suporte a USB incorporado.
O problema decorre do fato de que um controlador SSD não pode gravar dados na memória flash e como o seu controlador específico lida com isso. Como o controlador SSD não pode gravar dados em flash, ele deve excluir os dados antigos primeiro. Mas outra limitação do flash é que o controlador SSD não pode excluir uma única página de dados por vez, mas precisa excluir um bloco inteiro (geralmente em torno de alguns megabytes) por vez. Para evitar isso, o controlador SSD grava os novos dados em um novo bloco e marca os dados antigos como inválidos. Em seguida, realiza a coleta de lixo, que basicamente exclui blocos cheios de dados inválidos.
O problema específico que você enfrenta é quando não há novos blocos vazios para gravar dados quando você deseja gravar alguns dados no SSD. Todos os blocos são preenchidos com dados válidos e inválidos. O controlador SSD deve passar pela coleta de lixo em um bloco em uso. O que ele faz é ler todos os dados de um bloco em um cache. Exclua dados inválidos no cache. Exclua todo o bloco de dados no flash. Em seguida, escreva os novos dados que você está gravando e os dados do cache no bloco agora limpo. Se várias delas acontecerem ao mesmo tempo, o controlador será inundado e basicamente deixará de responder até que possa limpar a lista de pendências.
Tudo isso acontece dentro do próprio SSD e é completamente oculto do sistema operacional. É por isso que não é possível encontrar as técnicas tradicionais de solução de problemas. Se todos os blocos no SSD tiverem dados, basta uma pequena gravação para forçar o SSD a passar por toda a dança de leitura / exclusão / gravação, por isso, não houve grandes gravações. SSDs modernos não têm o mesmo problema. Eles têm muitas técnicas incorporadas para evitá-lo, como coleta de lixo proativa ativa, caches de RAM e excesso de provisionamento. Eles podem sofrer uma queda na velocidade de gravação, mas não o suficiente para congelar o sistema.
A má notícia é que não há nada que você possa fazer para corrigi-lo além da atualização para um bom SSD. É uma falha de design no próprio SSD. Você pode tentar minimizar a quantidade de gravações no SSD. Isso tornaria a gagueira mais rara, mas não a consertaria completamente.
A parte surpreendente é que, em um PC com apenas 1 ano de idade, você tem um desses SSDs baseados em JMF602. Eles pararam de fabricá-los e vendê-los anos atrás.