Como Matt disse, há muitas razões que podem roubar seu espaço em disco, especialmente no Windows. Sim, pode ser de um spyware ou vírus, mas imagine esse problema como febre de um computador pequeno e, como tal, não é uma boa fonte de diagnóstico.
Por citar outro motivo ainda não citado, na época, a fragmentação do disco era um grande problema. Não tenho certeza se isso é verdade hoje, mas a Microsoft ainda aconselha fazê-lo no Windows 7 . Então vá em frente e desfragmentar de vez em quando, prestando atenção idealmente, você deve ter 15% de espaço livre antes de fazê-lo.
Eu amo o WinDirStat, pela resposta de splattne , e é realmente uma ferramenta perfeita para analisar o uso atual do disco, mas não para encontrar uma perda repentina de espaço livre. Seria muito melhor seguir o conselho do RedGritty e fazer uma pesquisa no Windows por arquivos grandes nos últimos dias - ou até mesmo misturar os dois. Não esqueça isso arquivos de log também crescem e são comedores de espaço em disco responsáveis, como o Viper disse.
Depois de encontrar o culpado, há uma boa chance de você fazer bom uso de msconfig para "remover" a origem do problema. Eu o usei por anos na minha máquina com Windows atrasado e sem antivírus ou qualquer tipo de proteção contra malware.
Portanto, meu conselho para encontrá-lo é usar todas as ferramentas disponíveis. Não existe uma ferramenta única capaz de ajudá-lo com um problema tão amplo. Outra ferramenta altamente ignorada em todos os sistemas operacionais é o analisador de logs. Console no mac, / log on linux e Event Viewer no windows. Pode dar algumas dicas sobre o que pode estar acontecendo com seu sistema, se você tiver sorte. No Windows, é ignorado por um bom motivo: na maioria das vezes, não registra informações suficientes.