Encontrei isso em outro site
Minimize todas as janelas
Clique com o botão direito do mouse na seção vazia da área de trabalho e selecione Novo => Atalho
Digite isso na janela que se abre: taskkill.exe / IM skype.exe / T e pressione Enter (ou clique em 'Avançar')
Digite o nome do atalho (meu nome usual é SkypeKill) e clique em 'Concluir' (ou pressione Enter)
Fixar (arrastar) o atalho na barra de tarefas para que o Skype possa ser fechado e desligado com um único clique neste ícone da barra de tarefas.
É isso aí. O que isso faz é:
/ IM fecha normalmente um processo com o "nome da imagem" skype.exe
/ T fecha todos os processos associados skype.exe aberto
Se o Skype não fechar bem com isso (eu o vi em alguns computadores), anexo '/ F' ao final do comando taskkill para fechá-lo com força: taskkill.exe / IM skype.exe / T / F