"Diretórios com extensões de arquivo" (bundles) são uma maneira comum no OS X de agrupar vários arquivos em um único pacote, como extensões do kernel, arquivos do iWork (antes do iWork 09), projetos do iMovie, aplicativos, etc.
Você geralmente pode editar o Info.plistarquivo de um aplicativo para remover a definição do pacote ofensivo definido - por exemplo, .themepara o iMovie.
Como .serviceestá definido para os serviços do sistema (veja, por exemplo, /System/Library/Services- acessá-los a partir do item da barra de menus do aplicativo e, em seguida, selecione Serviços ), você provavelmente quebraria as coisas removendo essa definição.
Se você está com sorte:
Abra, /System/Library/CoreServices/CoreTypes.bundle/Contents/Info.plistpor exemplo, usando o Xcode (depois de alterar as permissões de arquivo e diretório usando chmodno Terminal) e remova a entrada incorreta na matriz CFBundleDocumentTypes .

Você precisa de permissões de administrador para fazer isso. Eu recomendo ter backups atuais. É possível que algo se rompa se essa associação não for puramente cosmética.