O Meld 1.5.1 usa gtksourceview (via pygtksourceview) para destacar a sintaxe, no entanto, não consigo descobrir como configurá-lo para usar um estilo específico (esquema de cores / tema) daqueles disponíveis para o gtksourceview.
Talvez a solução esteja fora do meld - por exemplo, configurações do estilo padrão usado para o gtksourceview em geral, ou algo semelhante.