Para o layout, eu evitaria ter / tmp, / var e / home no SSD.
Com ou sem SSD, minhas preferências vão para um tmpfs / tmp e um HDD RAID1 / home (porque é barato)
Quanto ao / var, meu / var / log tende a ficar muito grande, portanto / var geralmente é um RAID1 dedicado aos arquivos do sistema. Sua milhagem irá variar.
Eu definitivamente usaria "noatime" e "descartar" (cf. ponto 3)
Algumas pessoas disseram / gostam de remover o diário ext3 também. Eu não tentei isso, nem tentei ext4.
O kernel deve pelo menos suportar a opção TRIM : isto é montar o disco com a opção de montagem "discard".
Há também alguns ajustes "hdparm" e ajustes de BIOS possíveis, mas eu não brinquei com isso.