Respostas:
A diferença entre [eles] é se você possui certos caracteres especiais nos campos de texto; por exemplo, um caractere acentuado (idioma estrangeiro). Se você exportar como Windows CSV, esses campos serão codificados usando a página de código do Windows-1252. A codificação DOS geralmente usa a página de código 437, que mapeia os caracteres usados em PCs anteriores ao Windows. Se você exportar como um e depois importar com uma ferramenta que espera o outro, a maioria das coisas ficará bem, mas você obterá resultados inesperados se, por exemplo, conhecer alguém com um trema (ou outro caractere estrangeiro) em seu nome.