Não, a menos que o ímã seja REALMENTE forte (veja a citação abaixo). Não há material magnético suficiente neles.
"Um ímã poderoso o suficiente para perturbar os elétrons no flash seria poderoso o suficiente para sugar o ferro das células sanguíneas"
Se a citação acima for o caso, você não deve estar trabalhando onde trabalha.
Também é um grande mito que ímãs normais podem arruinar os discos rígidos.
O mesmo vale para discos rígidos. Os únicos ímãs poderosos o suficiente para remover os dados de um prato de unidade são desmagnetizadores de laboratório ou aqueles usados por agências governamentais para limpar partes da mídia.
Mas esses disquetes, não os deixe perto dos seus ímãs.
Fonte: Rebentando os Maiores Mitos do PC | PCWorld