Recentemente, também tive esse problema, depois de instalar uma VM do Windows 7 para o trabalho. Não usar o Windows por algum tempo, também foi muito irritante para mim.
Eu tinha uma instalação limpa do Windows 7, atualizada para o service pack mais recente até o momento, e me recusei a instalar o Silverlight. No entanto, parece que os service packs do Windows 7 agora "pré-carregam" partes do Silverlight, fazendo com que sejam exibidos no Windows Update, mesmo quando não estão tecnicamente totalmente instalados. Altamente irritante.
Para corrigir esse problema, segui as instruções de remoção no seguinte artigo no site de suporte da Microsoft: Como limpar uma instalação corrompida do Silverlight e reinstalar o Silverlight .
Depois de fazer a remoção completa da seção "Deixe-me consertar", o Silverlight não apareceu nenhuma vez no meu Windows Update.
Atualização (2015 09 17): se você tiver o Microsoft Office instalado, isso não funcionará. Funciona no Windows 7, conforme descrito. Ao instalar o Office 2013, o Silverlight é instalado e as atualizações no Microsoft Update persistem. Ainda não encontrei uma maneira de pará-lo com o Office instalado. Sem o Office, talvez apenas o Office 2013, essas instruções ainda funcionam .