Respostas:
Atualização: Como parece haver um erro no ahk em vez de no seu script.
Aqui estão alguns outros softwares de remapeamento de chave que você pode experimentar:
http://www.randyrants.com/sharpkeys/
http://webpages.charter.net/krumsick/
http://www.softarium.com/keyremapper/
Não é gratuito (avaliações):
http://atnsoft.com/keymanager/
http://www.inchwest.com/hotkeycontrol/downloads
A maneira mais hardcore é a edição do registro:
http://msdn.microsoft.com/en-us/windows/hardware/gg463447.aspx
Software de manipulação de entrada usando script (como autohotkey) :
http://www.autoitscript.com/site/autoit/
https://sites.google.com/site/carlkenner/glovepie
Post antigo:
Em primeiro lugar. Observe as configurações do seu aplicativo cad para verificar se não há como reativar as teclas de atalho no aplicativo.
Um software muito popular para macros e teclas é o auothotkey
http://www.autohotkey.com/download/
Aqui está um guia para remapear as chaves.
http://www.autohotkey.com/docs/misc/Remap.htm
Definitivamente, deve haver uma maneira de iniciar o script e o aplicativo de remapeamento pelo mesmo tempo ...
Um script em lote pode realmente fazer o truque, no entanto.