Não conheço um programa que possa mostrar o acesso por porcentagem (pelo menos não por meio de uma função interna), mas se tudo o que você precisa fazer é ver qual programa está acessando fortemente a unidade, use o Process Monitor para ver todos os arquivos e pastas acessados. Você pode selecionar o filtro Arquivos para ver apenas o acesso ao disco e clicar com o botão direito do mouse em qualquer coisa que pareça normal para filtrá-lo para reduzir ainda mais a bagunça e reduzi-lo até o acesso pesado / inesperado:
Você também pode exportar os dados para um arquivo CSV e abri-lo em outro programa para representar graficamente um gráfico, mas provavelmente é muito mais fácil visualizar os acessos na lista.
(Pessoalmente, prefiro o Filemon ao invés do ProcMon, mas isso só funciona no XP.)
DiskMon, que mostra o acesso direto ao disco (ou seja, ao próprio disco, em oposição a arquivos ou pastas específicos, mas não mostra o processo).