Eu normalmente uso o Terminator no Linux, e um dos recursos que eu gosto é a capacidade de ajustar arbitrariamente o tamanho das telas divididas.
Por exemplo: http://oracleview.files.wordpress.com/2011/04/terminator-mad1.png
O ConEmu possui esse recurso? Acabei de dividir a tela em duas telas horizontais, mas não consegui ajustar o tamanho. Eles parecem estar consertados.