Se a unidade não inicializar, há algo errado com o MBR ou não existe, então essa é a sua "verificação". No entanto, o comando bootrec.exe /ScanOs
deve exibir a lista de registros ativos do MBR. Se não houver, está faltando ou está corrompido.
O comentário de Kruug está correto: se você clonou incorretamente a unidade (por exemplo, clonou apenas uma partição), o MBR pode não ter sido copiado. Para clonar com êxito uma unidade inicializável, é necessário fazer um clone 1 para 1 ou usar uma ferramenta que permita clonar o MBR e as partições selecionadas. Pessoalmente, eu uso o Macrium Reflect .
Quanto à reparação, usando um disco de inicialização do Windows:
Na tela inicial do Windows, clique em "Reparar o computador"
Após uma breve varredura de hardware, na "tela Opções de recuperação do sistema", clique na opção inferior do prompt de comando:
No prompt de comando, digite os seguintes comandos (cada um deve seguir com uma "Operação bem-sucedida"):
bootrec.exe /FixMbr
bootrec.exe /FixBoot
Fonte: Hardware de Tom