Minha sugestão para você é fazer isso com grep- um utilitário para sistemas do tipo UNIX que foi portado para o Windows e pode corresponder a linhas usando expressões regulares.
grepestá incluído no pacote MSYS do MinGW, o instalador pode ser encontrado aqui . (instale apenas o MSYS)
Então você terá que adicionar ferramentas MSYS à sua variável PATH, o diretório dafeult para MSYS é C:\MinGW\msys\1.0\bin
Finalmente, você pode fazer sua busca com este comando:
ls -a | grep ^.+\..+\.r[0-9]+$
... o que significa: "obter saída de ls -a(lista de arquivos, incluindo arquivos ocultos) e passá-la para grep, corresponder linhas que se parecem com . .r [0-9] * (com pelo menos um caractere simbolizado por cada asterisco)".