Você está olhando para duas coisas diferentes.
A primeira coisa é os servidores DNS usados pelo roteador. Os roteadores estão fazendo o DHCP para obter um endereço IP do provedor. Na resposta do DHCP, o ISP informa ao roteador qual endereço IP usar e também que Servidores DNS usam. Alguns roteadores oferecem uma interface da Web na qual você pode substituir os servidores DNS e inserir os que deseja usar.
A segunda coisa é o DNS dinâmico. Um roteador com DynDNS está registrando no provedor DynDNS cada vez que ele recebe um novo endereço IP. Esse registro pode, por exemplo, ser tão simples quanto abrir uma página da Web como " http://dyndns-provider.com/register-new-address?dnsname=...&name=...&password= ...". Após o registro, o provedor DynDNS atualizará a entrada SRV em seu servidor DNS para que os clientes que solicitam o endereço IP para o seu nome DynDNS obtenham o novo endereço IP.
O registro no provedor DynDNS não está relacionado às entradas DNS do roteador, não tem efeito sobre eles. Então, o que você quer alcançar não é possível dessa maneira.