Eu descobri uma solução alternativa para isso, se você criar um link físico para o chrome.exe no mesmo diretório, poderá definir um perfil para esse executável independentemente.
C:\Program Files (x86)\Google\Chrome\Application>mklink /H gpu-chrome.exe chrome.exe
Hardlink created for gpu-chrome.exe <<===>> chrome.exe
Você precisará executar o cmd.exe no modo administrador: clique com o botão direito do mouse, execute como administrador .. e seu aplicativo Google Chrome pode estar em outra pasta como% USERPROFILE% \ AppData \ Local \ Google \ Chrome \ Application \
Agora eu posso executar o gpu-chrome.exe e ter aceleração 3D total no meu cartão dedicado.
Apenas clique com o botão direito do mouse neste novo .exe e defina uma nova GPU pré-determinada para executá-lo, como você fez antes da nVidia bloquear essa opção.