Devido à natureza exclusiva dos arquivos criptografados, podem ocorrer resultados diferentes ao mover ou copiar arquivos criptografados entre locais. Por exemplo, ao copiar um arquivo criptografado de uma máquina local para um servidor na rede, ocorrerão diferentes resultados da operação de cópia, dependendo do sistema operacional utilizado no servidor. Em geral, copiar um arquivo herdará as propriedades EFS do destino, mas uma operação de movimentação não herdará as propriedades EFS da pasta de destino.
A mensagem de erro "acesso negado" é retornada aos aplicativos do sistema de arquivos NTFS para garantir a compatibilidade com os aplicativos existentes. O uso de uma mensagem de erro alternativa ou mais descritiva faria com que muitos aplicativos falhassem ou se comportassem erraticamente.
O cliente Windows XP Professional contém alguns aprimoramentos na área de cópia de arquivos criptografados. Agora, a interface do shell e a linha de comando oferecem suporte a uma opção para permitir ou não a descriptografia de arquivos. Quando um arquivo criptografado é copiado para um local de destino que não permite criptografia remota, o usuário será solicitado com uma caixa de diálogo que permite escolher se deseja descriptografar ou não o arquivo.
