Como recuperar melhor a pasta arquivada que aparece como um arquivo na unidade NTFS?

Arquivei uma pasta em um disco rígido externo e mantive-a em sincronia com outra usando o Sync Toy. Agora vejo que a pasta aparece como um arquivo de 0 bytes em ambos os HDDs. Tudo o resto é bom e legível. Eu estou usando o Windows 7 64bit Home Premium e NTFS em todos os discos. O checkdisk é seguro ou devo tentar algumas ferramentas de recuperação primeiro? Como você abordaria essa questão?

Eu usei uma ferramenta gratuita (para uso pessoal) chamada Recuva que conseguiu encontrar essas pastas perdidas e arquivos com sucesso. Eu só perdi nomes de algumas pastas e arquivos.

Também correu a ferramenta do Windows Check Disk, que não encontrou nenhum problema. Ímpar. Parece que o Sync Toy não é o culpado aqui.