Variáveis de configuração não são opções, elas apenas "emulam" as dos plugins. Portanto, você não usa :set, mas :let(e :echopara listar o valor atual).
O sigilo na frente da variável determina seu escopo. g:significa global; esses geralmente precisam ser definidos antes do carregamento do plug-in, ou seja, colocando
let g:javascript_conceal = 1
no seu ~/.vimrc(e reinicie o Vim).
Como algumas configurações se aplicam apenas a certos tipos de arquivos , eles usam o b:prefixo. Configurá-los ~/.vimrcapenas os aplicaria ao primeiro buffer aberto, que não é o que você deseja. Em vez disso, você precisa se conectar ao mecanismo de detecção de tipo de arquivo .
Se você deseja habilitar apenas uma opção de configuração para certos tipos de arquivos, use :let b:var = valuee insira os comandos correspondentes em ~/.vim/after/ftplugin/{filetype}.vim, onde {filetype}está o tipo de arquivo real (por exemplo javascript). (Isso requer que você tenha :filetype plugin on; o uso do diretório after permite substituir qualquer configuração de tipo de arquivo padrão feita por $VIMRUNTIME/ftplugin/{filetype}.vim.)
Como alternativa, você pode definir um :autocmd FileType {filetype} setlocal option=valuediretamente no seu ~/.vimrc, mas isso tende a se tornar pesado depois de muitas personalizações.
autocmd Filetype javascript let b:javascript_fold = 1