Primeiro o! é o símbolo NÃO.
iptables -A INPUT -p tcp -m tcp -m multiport ! --dports 80,443 -j DROP
Segundo, as regras que você escreveu podem não ter os resultados esperados. Você elimina tudo, incluindo a resposta à conexão na porta 80. Portanto, não será possível conectar-se a ela para fins de um servidor da web.
Essas regras permitem conexões RELACIONADAS e ESTABELECIDAS, para que um servidor web funcione, se é isso que você está tentando fazer.
iptables -A INPUT -p tcp -m tcp -m multiport --dports 80,443 -j ACCEPT
<insert further allowed list here>
iptables -A INPUT -m conntrack -j ACCEPT --ctstate RELATED,ESTABLISHED
iptables -A INPUT -m state --state ESTABLISHED,RELATED -j ACCEPT
iptables -A INPUT -j DROP
iptables -A OUTPUT -m state --state ESTABLISHED,RELATED -j ACCEPT
iptables -A OUTPUT -j DROP
iptables -A FORWARD -m state --state ESTABLISHED,RELATED -j ACCEPT
iptables -A FORWARD -j DROP