O interior do túnel não está nas águas de ninguém, e as duas nações estabeleceram um acordo sobre tais questões, o Protocolo sobre controle de fronteiras e policiamento, cooperação em justiça criminal, segurança pública e assistência mútua em relação ao link fixo do Canal . Ele prevê que cada estado exerça jurisdição em "zonas de controle" no território um do outro (por exemplo, áreas de controle de fronteira). A fronteira em si é estabelecida no meio do túnel pelo Tratado de Canterbury (a de 1986, a 1416 era sobre uma aliança contra a França).
Dentro do próprio túnel, o Artigo 38 do Protocolo diz que cada estado tem jurisdição em seu território, incluindo as partes dos túneis do lado da fronteira, mas prevê que ambos os estados tenham jurisdição em vários casos, como onde ninguém sabe ao certo onde ocorreu uma ofensa e prioriza o estado que apanha alguém primeiro.
A fronteira é marcada dentro do túnel de serviço .
Quanto às águas acima do túnel, este mapa indica que a área estreita do Estreito de Dover fica inteiramente dentro das águas territoriais do Reino Unido ou da França.