O governo dos EUA não especifica publicamente como decide a elegibilidade de uma pessoa para um visto; portanto, não pode haver uma resposta "oficial" à sua consulta.
Em geral, sua embaixada local saberá apenas que você se inscreveu na Loteria do Green Card, se você for selecionado, pois esses nomes serão enviados à embaixada, nomes não selecionados que não o são. Mas eles perguntam se você já se inscreveu anteriormente. E, portanto, cabe a você decidir como ser honesto.
O que um advogado de imigração me disse (um vizinho) é que, se suas qualificações são sólidas para o visto, a inscrição na loteria tem pouco efeito. Mas se você é limítrofe, torna-se um fator maior.