Os segmentos de trem são tratados de maneira diferente dos segmentos das companhias aéreas, e as implicações para os segmentos ignorados são ligeiramente diferentes.
Ao contrário dos segmentos aéreos, a companhia aérea não tem como saber se você realmente embarcou no trem, apenas que você comprou os bilhetes. Portanto, desde que você compre seus bilhetes de trem (não apenas seus cartões de embarque!) Em Schiphol, será considerado que você "voou" nesse segmento e, portanto, não terá nenhuma implicação em ignorá-lo - porque, até a companhia aérea está preocupado que você não pulou. Isso é verdade mesmo se você tiver segmentos subsequentes - eles NÃO serão cancelados nesse caso, pois a companhia aérea considerará que você usou esse segmento. Você ainda receberá milhas de passageiro frequente por ter "voado"!
Parece que você está apenas seguindo um caminho - mas se você está retornando pela mesma rota, no retorno, é uma história diferente. Você será solicitado a fazer o check-in em sua origem, que (presumindo algo como Brussels Midi-> Amsterdam-> Cairo) está em Bruxelas. Se você aparecer em Amsterdã e tentar fazer o check-in, eles o recusarão, pois saberão que você pulou a perna do trem Bruxelas-Amsterdã.