Resumo:
Sim. Você precisará mostrar seu novo passaporte para a companhia aérea. Eles não se importarão que você já tenha contado a eles sobre um passaporte diferente. Você pode atualizar o passaporte associado à sua reserva on-line antes de fazer o check-in.
Discussão:
Eu acho que a suposição de que é caro alterar os detalhes do passaporte em seu registro é falsa. Ao fazer o check-in, basta dizer: "Tenho um novo passaporte, aqui está ele". De fato, você pode simplesmente dizer "aqui está o meu passaporte"; Ninguém se importa que seja novo. Faço isso o tempo todo, verificando com um passaporte diferente daquele que a companhia aérea já conhece; ninguém nem pisca.
Algumas companhias aéreas "níquel e centavo" (isto é, orçamento) cobram, aparentemente, se o funcionário tiver que digitar os detalhes do passaporte durante o check-in. Ou, mais precisamente, se o funcionário tiver que passar o passaporte no scanner. Para evitar essa cobrança, você deve visitar o site da empresa após obter seu novo passaporte e procurar sua reserva. Você deve poder atualizar as informações do seu passaporte on-line, evitando a cobrança.
De qualquer forma, se você estiver usando a nova nacionalidade para viajar para algum lugar sem visto, terá que mostrar o passaporte para a companhia aérea ou eles não o deixarão no avião. Você precisa provar a eles que possui os documentos necessários para entrar no país, porque se você não tiver esses documentos, a companhia aérea será multada pesadamente por levá-lo até lá. Portanto, se você não mostrar o novo passaporte, precisará mostrar um visto que não possui.
Existem muitos posts aqui e em outros lugares na internet explicando como isso funciona. As regras básicas são as seguintes:
Ao fazer o check-in, mostre os documentos que você usará para entrar no país de destino. No caso de um trânsito, pode ser necessário mostrar mais de um passaporte, se, por exemplo, um exigir um visto no aeroporto de trânsito e o outro exigir um visto no destino.
Ao entrar em qualquer país, mostre os documentos que oferecem a melhor vantagem.
Quando você sair de qualquer país, se houver controle de passaporte na saída, mostre os documentos que você usou para entrar. Uma exceção: se você é nacional do país em que está saindo, geralmente deve mostrar esses documentos, mesmo se tiver digitado com documentos diferentes.
Pode haver algumas exceções a essas regras, especialmente se uma de suas nacionalidades for de um país com restrições contra a dupla nacionalidade. Viajei pela UE e entre os EUA e o Canadá, filtrando esses princípios, sem nenhum problema.