Quando visitei Dubai há alguns anos, eles nunca perguntaram sobre minhas opiniões religiosas. Não está no formulário que eles lhe dão, não está no meu passaporte e documentos de viagem e eles nunca me perguntaram verbalmente. Portanto, passar pela imigração não será um problema.
Além disso, Dubai está cheia de trabalhadores não muçulmanos, principalmente filipinos, indianos, britânicos e americanos. Os árabes preferem contratar não-árabes para trabalhos que não desejam fazer por si mesmos ou para conhecimentos específicos. Se eles tivessem problemas com outras religiões, teriam que dispensar a maior parte de sua força de trabalho, que na maior parte é católica, cristã protestante, budista ou hindu. (Muitos provavelmente são secretamente agnósticos ou seculares e apenas dizem que são uma religião específica apenas para se misturarem à sua cultura religiosa.)
Dito isto, eu não recomendaria entrar em discussões religiosas sobre ateísmo enquanto estivesse lá. Embora permitam que os convidados em seu país não sejam muçulmanos, eles não são gentis com alguém que tenta converter pessoas em outra religião (ou convencem as pessoas de que Deus não existe). E colocar um debate lógico sobre os méritos do ateísmo poderia ser considerado uma tentativa de converter alguém, e possivelmente ser interpretado como um insulto ao seu Deus (ou seja, Allah), já que você estaria negando abertamente que Ele existe.
Então, basicamente, segure sua língua e você provavelmente ficará bem.