É possível (para um agente de viagens com conhecimento incomum), mas não é fácil.
Existem dois campos no PNR para cada companhia aérea, o campo FQTV (número de viajante frequente para ganhar milhas) e o campo FQTS (número de viajante frequente para fins de status).
Estes podem ser definidos para valores diferentes. Mas os sistemas de TI das companhias aéreas nem sempre são projetados para entender que isso pode acontecer; portanto, mesmo que você consiga encontrar um agente de viagens que entenda o que você está falando, não há garantia de que ele funcione.
Se você usar uma ferramenta como a ferramenta gratuita MyFlights, ela informará quais números você anexou à reserva e se são FQTV ou FQTS (ou outro tipo de número FQT). MyFlights está disponível apenas para reservas da Amadeus.