Há um ótimo artigo eHow sobre esse mesmo tópico.
Mas sim, no que diz respeito à sua mochila, a maioria das mochilas parece ter capa de chuva nos dias de hoje. Também carrego um poncho de emergência para mim, embora só tenha usado um uma vez (Cataratas do Iguaçu).
Além disso, você pode embrulhar suas roupas em sacos plásticos DENTRO da mochila. Não se esqueça de dobrar seus equipamentos eletrônicos. As roupas podem secar, nem todos os eletrônicos.
Você também pode colocar sacolas plásticas em torno de seus sapatos, se estiver muito molhado, mas pode ser difícil andar com eles.
A melhor resposta é procurar abrigo o mais rápido possível e depois fazer o que os locais fazem.