Sim, é feita uma entrevista de segurança em todos os voos domésticos de Israel, bem como em todos os vôos de partida e vôos de entrada de Israel.
De acordo com o meu conhecimento e com a minha experiência, não há diferença na entrevista e na verificação de segurança entre voos internacionais e domésticos. A única diferença é que (pelo menos para os cidadãos israelenses) não é necessário um passaporte e outras formas de identificação podem ser usadas, como carteira de motorista ou carteira de identidade.
Mas, como @Zach Lipton observou em seu comentário, todo o processo de pré-vôo é mais curto; portanto, os passageiros são aconselhados a chegar apenas de 1 a 1: 30 horas antes do voo e não 3 como nos voos internacionais:
Arkia (site em hebraico):
מועדי התייצבות בשדה התעופה לפני מועד הטיסה:
בשעתב"ג ובאילת- 1:30 שעות לפני מועד הטיסה.
בשדה דב ובחיפה- 1:15 ות לפני מועד הטיסה.
Minha tradução:
Horário de chegada ao aeroporto antes do horário de partida:
Ben Gution e Eilat - 1:30 horas antes da partida.
Sde Dov e Haifa - 1:15 horas antes da partida.
Israir (site em inglês):
Os voos domésticos do Aeroporto Ben Gurion partem do Terminal 1.
Para voos em jato (ô "à), os passageiros das aeronaves devem chegar ao aeroporto uma hora e meia antes da decolagem."
Para voos em aeronaves ATR (ô "à), os passageiros devem chegar ao aeroporto uma hora antes da decolagem.