Respostas:
Com base em muitos voos intra-UE da Ryanair, nunca tive a impressão de verificar o documento indicado, mas apenas um documento válido correspondente ao passageiro. Não está indicado no cartão de embarque e não acho que eles possam vê-lo no computador. Provavelmente já viajei com um documento diferente do indicado on-line e ninguém nem percebeu. Eu não me preocuparia muito com isso.
Isso pode ser bem diferente do que as fontes oficiais dizem.