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Uma opção é pegar o trem. Acabei de procurar um dia da semana aleatório em setembro e há basicamente um trem por hora em cada direção. É direto e leva apenas 4 horas. Para obter horários de trem, sua melhor aposta é usar o Bahn.de e pesquisar a partir daí. (Sim, são as ferrovias alemãs e não as italianas que estou sugerindo, mas elas têm um site melhor e podem pesquisar basicamente toda a Europa!)
Em termos de barato, não é tão ruim. É um retorno de cerca de € 100 se você reservar com antecedência em trens específicos (Mini), chegando a cerca de € 200 para um bilhete flexível (Flessibile).
Concordo que o trem é a opção mais barata - especialmente se você tirar proveito dos bilhetes com desconto do Trenitalia MINI - consulte meu artigo de blog sobre tarifas da Trenitalia para obter mais informações. Esses ingressos podem ser comprados com 4 meses de antecedência ou no dia anterior - se ainda estiverem disponíveis.
Você também pode voar via Easyjet. Se você reservar com antecedência, poderá voar de ida e volta por menos de € 55. Existem taxas adicionais para bagagem, etc., mas ainda é muito barato. Você terá que levar em conta os custos de ir e vir de cada aeroporto. É uma viagem de ônibus fácil por 2,50 € a partir do aeroporto VCE; O FCO é um pouco mais caro, embora a Terravision tenha retomado o serviço de ônibus e custando apenas € 6.
Prefiro o site Trenitalia, mas tive muita experiência em usá-lo! Para obter ajuda sobre trens na Itália, você pode ler meu artigo no blog Riding Trains in Italy . Veja também meu artigo de blog sobre a compra de ingressos on-line na Trenitalia . Boa sorte!