O que eu achei que funcionou para mim é com o Android Studio em execução (antes de iniciar o download do patch de atualização) eu fiz ps -ef|grep jre
na linha de comando e vi que havia dois processos em execução, o do Android Studio e o do Gradle, que era também usando o jre enviado no Android Studio. O processo do daemon Gradle terá algo parecido com isto:
gradle-5.3.1/lib/gradle-launcher-5.3.1.jar org.gradle.launcher.daemon.bootstrap.GradleDaemon 5.3.1
no final de sua linha de comando, quando você lista processos com ps
a versão específica que você possui, é claro que não pode ser 5.3.1.
Ao finalizar o processo Gradle, iniciar o download da atualização e reiniciar a partir do Android Studio, deixe a atualização prosseguir com êxito.