Com o Ubuntu 13.04 após a instalação do libbsapi policykit-1-fingerprint-gui fingerprint-gui, quando tentamos executar o fingerprint-gui, especialmente aqueles que possuem 138a: 008 (VFS301), o dispositivo não sopra após a primeira iniciação e, portanto, você não pode prosseguir.
Isso foi corrigido na versão libfprint 1.5.1 e, portanto, baixe o código-fonte e compile-o. Não use a versão da barra de ativação, pois ela possui um problema de identificação dev_open.
Também após a instalação, faça ln -s para /usr/local/lib/libfprint.s0.0.0.0 em /usr/lib/libfprint.s0.0.0.0. Caso contrário, ele apontaria para a versão antiga instalada usando o apt-get.
Isso aconteceu comigo e depois de instalar a versão mais recente do libfprint, consegui.