Nomacs vai nessa direção, mas não é exatamente o que você pediu.
Eu tive a mesma pergunta há muito tempo, já que a melhor organização de imagens é um diretório em árvore, não um conjunto de tags no banco de dados que você corre o risco de perder sempre que reinstalar o Linux.
O Nomacs tem uma opção no menu Arquivo chamada "Digitalizar pasta recursiva", que permite saltar de uma subpasta para outra, no modo de exibição, no modo de apresentação de slides ou qualquer outra coisa. Porém, ele não mostra todas as miniaturas no mesmo local.
No menu de painéis, "Visualização em miniatura" permite visualizar muito rapidamente o conteúdo da sua pasta. Ele só precisa de uma opção de navegação que mostre pastas ao lado da outra na linha do tempo. Vamos fazer uma solicitação de recurso, os desenvolvedores são bastante responsivos :)