@ errado, na minha opinião você não precisa sincronizar o IPod com o Rhythmbox. É o mesmo que Sincronização manual, onde você sincroniza apenas se desejar.
Não sei se você pode arrastar e soltar no IPod sem vinculá-lo a algum software. Meu conhecimento determina que o iTunes foi feito para desempenhar o papel e, desde então, outros jogadores ofereceram um caminho mais fácil e melhor para fazer o mesmo.
Acredito que RB, banshee e outros players apenas reconheçam o IPod e não participem da implantação de quaisquer impressões no ipod player.
No Controle manual no RhythmBox, você está basicamente arrastando e soltando. Essa pode não ser a resposta exata, mas, se não você, ajudará outras pessoas que buscam informações.
Felicidades.