Essas são mensagens normais a serem recebidas ao lidar com pacotes e estão realmente lá para impedir que você precise executar qualquer ação. Sem esses gatilhos, você precisaria sair / fazer login ou reiniciar para que algumas alterações apareçam.
A razão pela qual eles existem existe para dar a outras ferramentas a chance de atualizar - por exemplo, a lista de aplicativos no painel da unidade precisaria ser atualizada para não mostrar itens recém-removidos. Existem outros gatilhos para páginas de manual (documentação), gerenciador de inicialização grub (novas versões do kernel) e muitos outros.