Tanto quanto sei, não há lugar para scripts personalizados do Linux. O diretório que deve ser usado para instalação personalizada é o /optdiretório, portanto, seria a opção mais segura para colocá-los lá. Mas lembre-se de que, para que um script possa ser usado sem o caminho completo, você precisa que ele seja incluído na variável PATH.
Se precisar de ajuda para alterar a PATHvariável para todos os usuários, verifique Como configurar variáveis PATH para todos os usuários em um servidor? que refere o /etc/environmentarquivo para configurar isso.
Se sua preocupação é evitar conflitos, mas você não deseja adicionar outra rota à variável PATH, você pode usar /usr/local/bin. Na instalação do meu servidor, ele não possui nenhum arquivo, pelo que pode ser uma solução fácil.
Espero que ajude