aconteceu com um aplicativo qt5 usando o tema gtk no Ubuntu MATE
$ ./my-application
Gtk-Message: Failed to load module "canberra-gtk-module"
Gtk-Message: Failed to load module "topmenu-gtk-module"
vamos localizar as bibliotecas
$ locate libcanberra-gtk-module.so
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/gtk-2.0/modules/libcanberra-gtk-module.so
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/gtk-3.0/modules/libcanberra-gtk-module.so
definir o LD_LIBRARY_PATH resolve o problema
$ LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/gtk-3.0/modules:$LD_LIBRARY_PATH ./my-application
ou desmarque a variável de ambiente GTK_MODULES
$ unset GTK_MODULES; ./my-application