Respostas:
Parece que a opção -an deve fazer o truque. Acabei de executar um arquivo, confirmado, novo arquivo não tinha som.
-an (output)
Disable audio recording.
de http://manpages.ubuntu.com/manpages/precise/man1/avconv.1.html
Para meu entendimento, o -an
parâmetro simplesmente soltará o áudio da saída. Se não é o que você queria, você precisa usar o -map
comando e especificar como fluxos individuais de diferentes origens devem ser mapeados para a saída. O exemplo a seguir utiliza apenas o primeiro fluxo do primeiro arquivo (geralmente vídeo) e o áudio do segundo arquivo.
avconv -i input0.mkv -i input1.m4a -map 0:0 -c:v copy -map 1 -c:a copy output.mp4