Não é óbvio, olhando para a interface do usuário, que existem atalhos. No entanto, a maioria dos que funcionaram no Nautilus 3.4.2 (conforme usado em 12.04) ainda funciona em 3.6.
Esta lista pode não ser exaustiva. Sinta-se à vontade para editar esta resposta e adicionar mais se eu tiver perdido alguma. Todo o trabalho a seguir no Nautilus 3.6 (fornecido com o Ubuntu 13.04):
Nova guia Ctrl+T
New window Ctrl+N
Nova pasta Shift+ Ctrl+N
Abra a pasta na nova guia Shift+Return
Propriedades Alt+Return
Fechar janela Ctrl+W
Feche todas as janelas (sair) Ctrl+Q
Criar link Ctrl+M
Adicionar marcador Ctrl+D
Editar marcadores Ctrl+B
Desfazer Ctrl+Z
Refazer Ctrl+Y
Cut Ctrl+X
Copiar Ctrl+C
Colar Ctrl+V
Selecionar tudo Ctrl+A
Selecionar itens correspondentes a Ctrl+S
Inverter seleção Shift+ Ctrl+I
Mostrar arquivos ocultos Ctrl+H
Mais zoom Ctrl++
Diminuir o zoom Ctrl+-
Tamanho normal Ctrl+0
Ver lista Ctrl+1
Ícones visualizar Ctrl+2
Ir para o diretório inicial Alt+Home
Vá para o diretório pai Alt+Up Arrow
Voltar Alt+Left Arrow
Avançar Alt+Right Arrow
Ir para o local especificado Ctrl+L
Pesquisar arquivos (encontrar) Ctrl+F
Renomear F2