Em primeiro lugar, este não é o cache do sistema. O cache do sistema é um cache que reside na memória e ocupa memória física que não seria usada pelos aplicativos.
Esta é uma pasta .cache dentro do diretório inicial, portanto não é de todo o sistema. Você pode, se precisar do espaço, excluí-lo com segurança (apenas um programa que se comporte mal morrerá se você excluir o que é colocado em ~ / .cache).
Para responder sua pergunta, o deja-dup é uma ferramenta de backup fornecida pelo Ubuntu. O cache provavelmente ajuda a acompanhar todos os arquivos nos seus conjuntos de backup. Provavelmente economiza um bom tempo gerando essas informações sempre que o processo de backup é iniciado. Aparentemente, todo arquivo em seus conjuntos de backup possui assinaturas armazenadas em um cache.
O 5G parece muito, no entanto. Se você não usar o deja-dup ou não se importar com a perda de cache e com a lentidão da próxima vez que for iniciado, você poderá excluí-lo.