No Ubuntu 12.04 ou 14.04 com Unity, o seguinte pode interromper sua configuração do Apt.
No sistema -> preferências -> proxy da rede, ative a Configuração automática do proxy> e insira o URL do PAC.
Em seguida, pressione aplicar todo o sistema, e isso deve funcionar.
O problema é que o Apt não tem conceito de "no_proxy" e, portanto, tenta enviar todo o tráfego para esse proxy. Existem algumas maneiras de contornar isso: uma é criar um arquivo de substituição específico para o Apt, dizendo-lhe para usar / ignorar um proxy. Retirado de /superuser/323488/ubuntu-system-wide-proxy-auto-configuration-pac-script
Acquire {
Retries "0";
HTTP {
Proxy "";
};
};
O outro é depois de clicar em Aplicar na página Proxy de Rede, editar o arquivo /etc/apt/apt.conf como root sudo gedit /etc/apt/apt.conf
e remover qualquer menção de proxy nesse arquivo.