Você pode fazer isso com ffmpeg e imagemagic. Instale-os se eles não estiverem instalados no seu PC.
Execute estas etapas no seu terminal:
1. Crie um diretório para tentar esta solução, é melhor fazer uma cópia duplicada dos vídeos antes de tentar isso.
mkdir temp
2. Copie todas as suas imagens para o diretório que temp
você criou.
cp *.JPG temp/.
3. Defina a resolução das suas imagens.
mogrify -resize 800x800 temp/*.JPG
4. Converta-os para serem transformados em transições suaves e faça um vídeo em mp4.
convert temp/*.JPG -delay 10 -morph 10 temp/%05d.jpg
ffmpeg -r 25 -qscale 2 -i temp/%05d.jpg output.mp4
O ffmpeg não está nos repositórios do Ubuntu 14.04, mas no 15.04!
fonte: http://www.itforeveryone.co.uk/image-to-video.html