Eu tive o mesmo problema, mas, no entanto, no meu caso, o ajuste das configurações do compiz não ajudou muito .
Eu também tinha drivers ATI instalados. Então notei que a ATI APENAS lançou novos , que dizem ter muito melhor suporte para os últimos X e Unity . No entanto, a ATI os liberou tarde demais, e eles não conseguiram acessar os repositórios do Ubuntu .
O que eu recomendo você é desinstalar o driver ATI (fglrx) Ubuntu instalado para você e obter o mais novo no site da ATI : http://support.amd.com/us/gpudownload/Pages/index.aspx
No meu caso, isso proporcionou uma melhoria incrível do desempenho geral. Espero que ajude você também!