A versão apache2 que foi publicada quando a versão Ubuntu 14.04 foi lançada é a 2.4.7 e, a partir desta versão, parece que, por razões de segurança, o novo diretório raiz do servidor é:
/var/www/html
Portanto, a partir de agora, é aqui que você deve colocar os arquivos para o seu site (local). Você não deve ter esse problema novamente com as futuras atualizações.
De qualquer forma, se você deseja alterar este diretório por outro, é necessário modificar (como root) a seguinte linha do /etc/apache2/sites-available/000-default.conf
arquivo ( sudo nano /etc/apache2/sites-available/000-default.conf
):
DocumentRoot /var/www/html
para
DocumentRoot /path/to/another/directory
Depois disso, para que as novas alterações entrem em vigor, é necessário reiniciar o servidor apache usando o seguinte comando:
sudo service apache2 restart