Acabei de instalar o Ubuntu 14.04 hoje à noite e estou tendo esse problema estranho com o foco do mouse e da janela.
Não consigo clicar em nenhum ícone do Unity Launcher. Além disso, não consigo clicar em janelas sem foco para trazê-las para a frente. Isso não funciona.
Não sei como explicar melhor isso. É aparentemente aleatório quando posso clicar em algo dentro de uma janela. Não consigo nem clicar no botão "X" para fechar ou na barra de título para mover a janela a maior parte do tempo. O que está causando esse comportamento?
Eu realmente quero começar a usar o Ubuntu como minha área de trabalho principal, mas sempre tive problemas estranhos como esse quando testava um lançamento. Em uma VM, não tenho problemas, mas após uma instalação real, tenho problemas.
Edit: Mais algumas informações, meu mouse é um mouse para jogos USB RAT5. Não que eu pense que é o mouse físico que está quebrado ... e o ponteiro não congela nem nada. Eu simplesmente não consigo clicar em nada na maioria das vezes.