Primeiro, diminuir a partição do Windows do ubuntu pode levar a dados corrompidos, perda desses dados e incapacidade de inicializar a partir da partição reduzida. Faça backup de todos os dados que você não deseja perder e continue.
Minha recomendação é reduzir a partição do Windows a partir do próprio Windows. Caso isso não seja possível, por qualquer motivo,
Deixe-me declarar novamente: ESTA NÃO É UMA BOA IDEIA. É MUITO FÁCIL DESTRUIR DADOS E CORROMPIR A PARTIÇÃO QUE ESTÁ DENTRO! Faça backup de seus arquivos antes de tentar isso!
Mas a ferramenta correta a ser usada no Ubuntu 13.10 e posterior é o Gparted. No Ubuntu 14.04 LTS, o Gparted não é instalado por padrão, mas pode ser encontrado no Centro de Software. Instale o Gparted (ou verifique se ele está instalado) e continue
Novamente, FAZER ISSO PODE CORROMPER OS DADOS OU QUEBRAR A PARTIÇÃO! VERIFIQUE SEUS ARQUIVOS PRIMEIRO!
Tudo o que você precisa fazer é desmontar o disco, redimensionar a partição e salvar as alterações. Em seguida, expanda a partição Ubuntu para preencher o novo espaço. Deixe espaço extra na partição que está diminuindo ou as coisas ficarão feias.