A caixa de diálogo em questão aqui é a que você obtém com a opção de menu de contexto "abrir com outros aplicativos". Parece que o Wine inseriu mais de uma dúzia de entradas para cada aplicativo que instalo, o que dificulta encontrar o aplicativo correto:
O que posso fazer para remover as duplicatas?
Atualização: Nenhuma das duas soluções realmente funciona. O bug é interessante, mas os sintomas não correspondem ao meu problema (não estou tendo problemas com a desinstalação de aplicativos, mas com as coisas que são inseridas após a instalação) e, com o outro, todas as referências ao aplicativo Wine são removidas , o que realmente piora o problema (embora possa ser uma solução aceitável se nada mais puder ser encontrado). Portanto, essa ainda é uma questão em aberto; quaisquer compradores?