Como a pergunta indica, o gedit possui alguns bugs irritantes (o cursor desaparece, etc.). Eu só preciso de guias, destaque de sintaxe e números de linha. Vou usá-lo principalmente para programação. Estou usando o Lubuntu.
edit: Obrigado pelas muitas sugestões, estou tentando sublime agora, mas ele não suporta nativamente o código Fortran, esqueci de mencionar isso na minha pergunta, mas, no entanto, o Sublime parece realmente bom. Qual destes suporta fortran?