Ao iniciar uma instância no EC2, você tem a opção de fornecer "dados do usuário" que estão disponíveis para a instância na primeira inicialização (e posterior). O Ubuntu consome os dados do usuário com um programa chamado cloud-init, que é incrivelmente poderoso.
Você pode desativar o byobu usando o recurso de configuração em nuvem fácil de usar do cloud-init.
Para desativar o byobu, tudo o que você precisa fazer é fornecer esses dados do usuário em duas linhas:
#cloud-config
byobu_by_default: disable
Detalhes completos sobre o cloud-init aqui: https://help.ubuntu.com/community/CloudInit
Sintaxe de configuração da nuvem, incluindo todas as outras coisas incríveis que você pode fazer com ele, aqui:
http://bazaar.launchpad.net/~cloud-init-dev/cloud-init/trunk/view/head:/doc/examples /cloud-config.txt